Hundred, a única arma que pode confrontar a misteriosa forma de vida Savage que ataca a Terra. Para se tornar um mestre das artes militares, que empunha esta Hundred, o Hayato Kisaragi consegue entrar na academia Little Garden. No entanto, ele sente uma sensação estranha, mas familiar em Emil Crossford, sua companheira de quarto, que de alguma forma o conhece de algum lugar. Além disso, assim que ele entra na escola, ele é desafiado para um duelo por Claire Harvey, lutadora mais poderoso da escola.